Հայկ Քոչարյանը պատմական գիտությունների թեկնածու է։ ՔՄՀԿ-ում նա պատասխանատու է իրականացվող ծրարերի կառավարման և զարգացման համար։ Հայկ Քոչարյանի գիտական հետաքրքրությունների շրջանակը ներառում է Մերձավոր Արեւելքում և Հարավային Կովկասում ընթացող հասարակական և քաղաքական գործընթացները, ինչպես նաև «Երեք ծովերի» տարածաշրջանի ենթակառուցվածքային ծրագրերը։